fix: 对齐配置策略并加固书签导入

1) src/bookmark-processor.js：加固书签导入
- config/user/ 不存在时先从 config/_default/ 初始化一套完整用户配置（符合“完全替换”策略）
- 优先更新 config/user/site.yml 的 navigation，确保包含 id: bookmarks；失败再兼容旧 navigation.yml
- 无 .html 书签文件时由报错改为警告并跳过，不阻塞流程
- 导航更新日志按结果输出，不再无条件“已更新”

2) config/README.md：修正文档
- 明确配置加载为“完全替换、不合并”
- 补充首次使用建议：复制 config/_default/ 到 config/user/

3) package.json：许可证对齐
- license 从 MIT 改为 AGPL-3.0-only（与 LICENSE/README 对齐）

4) .gitignore：忽略工具目录
- 新增忽略 .serena/

.gitignore

@@ -12,6 +12,7 @@ dist/
 .cursorindexingignore
 .cursor
 .spec-workflow/
+.serena/
 
 # 系统文件
 .DS_Store